Michael Pfleger verfügt über eine umfangreiche berufliche Laufbahn. Von 2007 bis 2019 diente er als Offizier in der Bundeswehr. Anschließend wechselte er 2020 in die zivile Berufswelt und war bis 2023 als Manager bei PD - Berater der öffentlichen Hand GmbH tätig, wo er sich auf die Beratung im öffentlichen Sektor spezialisierte. Seit 2024 ist er als Gesamtprogrammleiter für das Programm zur Gesamtsteuerung der Registermodernisierung (RegMo) tätig, wo er für die Leitung und Koordination des Projektes verantwortlich ist.